Dit zijriviertje van de Dommel is zo'n 20 kilometer lang. Het ontstaat op de Jekschotse Heide, tegenwoordig een landbouwontginning, ten noorden van het Vresselse Bos. Vandaar stroomt het in noordwestelijke richting langs de buurtschap Koevering naar het natuurgebied De Geelders.
Daar volgt de waterloop een iets minder strakgetrokken traject op de grens tussen Schijndel en Sint-Oedenrode. Ten noorden van Gemonde, bij de Genenberg, mondt de Beeksche Waterloop in de Dommel uit.
In 1997 is het beekje van het Wilhelminakanaal tot aan de Geelders gegraven in het kader van de ruilverkaveling. De hoofdfunctie is wateraanvoer, maar daarnaast moet de Beeksche Waterloop ook verschillende natuurgebieden met elkaar te verbinden: een ecologische verbindingszone of EVZ in jargon.
In dat kader heeft het waterschap De Dommel, vaak in samenwerking met Brabants Landschap, al tientallen landschapselementen gerealiseerd, hoofdzakelijk poelen, omgeven door gras met opslag op een klein perceel. De bedoeling is dat die op den duur met elkaar verbonden worden. Vispassage Ter hoogte van Genenberg in Sint-Michielsgestel werd het waterpeil in de Beeksche Waterloop tot 2010 nog geregeld door een stuw. Die vormde echter een belemmering voor vissen. De stuw is daarom verwijderd en het waterschap heeft daarvoor in de plaats een zogenaamde bekkenvispassage aangelegd, bestaande uit negen stenen drempels, waardoor vissen het hoogteverschil in het water kunnen overbruggen. Met kleine sprongen zwemmen ze nu stroomopwaarts om zich in hoger gelegen gebieden voort te planten.
De vispassage werd op 8 maart 2010 door Tiny Arts, loco-watergraaf van Waterschap De Dommel, geopend, samen met Jan Baan, directeur van Brabants Landschap. Vissoorten zoals het bermpje en de riviergrondel kunnen nu weer stroomopwaarts zwemmen in dit deel van de Beeksche Waterloop.
Beekherstel
Naast de aanleg van de vispassage is ook de beek over een lengte van 400 meter heringericht. Er is een nieuwe, meanderende beek gegraven tussen de Dommel en de Genenberg. Een deel van de vrijgekomen grond is gebruikt om de oude loop te dempen. Dit stukje ecologische verbindingzone vormt nu een schakel tussen de natuurgebieden De Geelders en het Dommeldal.